农作物论文_赪桐全长转录组分析
2021-12-23文章摘要:赪桐作为药用和观赏价值兼备的林下植物具有较高的应用价值,但其基因的转录信息较少。本研究基于PacBio Sequel?测序平台开展赪桐根、茎、叶、花等组织部位的全长转录组测序,共获得31 368条转录本序列,利用Nr、KEGG、COG/KOG和SwissProt四大数据库共注释到30 473个基因。根据GO功能注释,分别有109 844条GO条目参与生物过程,75 764条参与细胞组分,28 724条参与分子功能。通过KEGG数据库分析,共有9 681条序列参与了138条代谢通路,其中有4 653条序列参与了43条次生代谢产物合成路径。全长转录组通过注释,预测到CDS序列31 368个,662个转录因子,5 405个跨膜蛋白,6 066个SSR,749个lncRNA。赪桐全长转录组的数据注释与分析,为研究赪桐基因功能、代谢通路调控及基因表达分析等提供了理论基础。
文章关键词:
项目基金:
上一篇:农业基础科学论文_2021中国农业科学重大进展
下一篇:植物保护论文_水稻叶部一种植物线虫的形态和分
